タイトルのエラーが発生して 500 (Internal Server Error)を返すようになった。
原因は .htaccess 内で「Options +FollowSymLinks」が存在していたこと。
さくらのレンタルサーバ上では上記オプションが使用できずエラーになるらしい。
該当箇所をコメントアウトしたところページが表示されるようになった。
Options +FollowSymLinks ↓ # Options +FollowSymLink
Options +FollowSymLinks ↓ # Options +FollowSymLink
# htpasswd -D [パスワードファイルの場所] [ユーザ名]
# htpasswd -c /etc/httpd/.htpasswd yokano [パスワードを2回入力]
# vi /etc/httpd/conf/httpd.conf
ファイルの末尾に以下を追加
<Directory "/var/www/html/secret">
AuthType Basic
AuthUserFile /etc/httpd/.htpasswd
AuthName "Please input id and password."
Require user yokano
</Directory>